Vandeputte è cresciuto nel settore giovanile del Gent, dove ha debuttato il 27 luglio 2013 nell’incontro di Pro League pareggiato 1-1 contro il Waasland-Beveren, in cui ha fornito l’assist per il gol della sua squadra. Nel 2014 è stato prestato al Roeselare e dal 2015 al 2017 ha giocato all’Eindhoven, sempre in prestito.
Nel 2017 è stato acquistato a titolo definitivo dalla Viterbese Castrense.Ha debuttato in Serie C il 27 agosto contro il Prato ed ha trovato subito la via del gol.[8]
Il 2 settembre 2019 è stato acquistato dal L.R. Vicenza a titolo definitivo. Promosso con il club al termine della stagione, il 26 settembre 2020 ha debuttato in Serie B nell’incontro perso 1-0 contro il Venezia.
Il 22 luglio 2021 è stato ceduto in prestito al Catanzaro, ed al termine della stagione si è unito al club calabrese a titolo definitivo. L’anno successivo lui è tra protagonisti della promozione in B dei giallorossi.
